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瓊脂糖凝膠電泳實驗之凝膠制作與點樣

更新時間:2014-12-10  |  點擊率:2732
 一、瓊脂糖凝膠制作
 
1、瓊脂糖凝膠濃度
 
   配制凝膠的濃度據實驗需要而變 ,一般在0.8% ~2.0%之間,如果一次配制凝膠100 ml,沒用完的凝膠可以再次融化,但隨著融化次數的增加,水分丟失也越多,凝膠濃度則會越來越高,導致實驗結果不穩(wěn)定,補水辦法:一是在容器上標記煮膠前的刻度,煮膠后補充相應的水分至原刻度;二是在煮膠前稱重,煮膠后補充水至原重量。粗略一點的方法是通過多次較恒定的煮膠條件得出一個經驗補水值。以保證凝膠濃度基本維持在原濃度。核酸染色劑溴化乙錠(ethidium bromide)可加在融化的瓊脂糖中,終濃度為0.5 t*g/ml;也可在電泳結束后染色。
 
2、梳板的選用
 
   一般每個制膠模具均配有多個齒型不同的梳板,梳齒寬厚,形成的點樣孑L容積較大,用于DNA 片段回收實驗等;相反,梳齒窄而薄,形成的點樣孑L容積就較小,用于PCR產物、酶切產物鑒定等。梳板的選擇主要是看上樣量的多少而定,一般來說,上樣量小時盡量選擇薄的梳板制膠,此時電泳條帶致密清晰,便于結果分析。另外,每次制膠時都要注意梳齒與底板的距離至少要1 mm,否則,拔梳板時易損壞凝膠孑L底層,導致點樣后樣品滲漏。當然,點樣孑L的破壞還與拔梳板的時間和方法有關,一般凝膠需冷卻30 min以上方可拔梳板,應急的情況下可以將成型的凝膠塊放4℃ 冰箱中冷卻15 min 左右,拔梳板的方法是將制膠槽放置在電泳槽中的電泳緩沖液中,然后垂直向上慢慢用力,因為有液體的潤滑作用,梳板易拔出且不易損壞點樣孑L。
 
二、點樣
 
    點樣需加上樣緩沖液,因為上樣緩沖液中加了甘油或蔗糖增加密度,使樣品沉入孑L底;指示樣品的遷移過程,上樣緩沖液中一般加了兩種指示劑,溴酚蘭和二甲苯青(值得注意的是指示劑并非染色劑,DNA染色劑是溴化乙錠,而且要在紫外光的激發(fā)下才能看見桔紅色熒光)。上樣緩沖液儲存液一般為6× (10×),表示其濃度為工作濃度的六倍。使用時上樣緩沖液應稀釋到一倍濃度。點樣方法是將移液器基本垂直點樣孑L,用另一只手幫助固定移液器下端,移液器槍頭(Tip)進入點樣孑L即可將樣品注入孑L內,千萬不可將Tip尖插至孑L底,并點上適合的DNA分子量標準,所謂適合是指樣品DNA分子量大小應基本在DNA分子量標準范圍之內。
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